De omnibus dubitandum.

「デー・オムニブス・ドゥビタンドゥム」と読みます。
dē は「～について」を意味する前置詞で、奪格をとります。
omnibus は「すべて」を意味する第3変化形容詞 omnis,-e の中性・複数・奪格です。名詞的に使われています。
dubitandum は「疑う」を意味する第1変化動詞 dubitō,-āre の動形容詞、中性・単数・主格です。「疑われるべき」と訳せます。
不規則動詞sumの直説法・現在、3人称単数の estが省かれています。dubitandum est は「動形容詞の非人称表現」と呼ばれます。「疑われるべきことが（dubitandum）ある（est）」という意味から、「疑うべきである」と訳します。
「すべてについて疑うべし」という意味です。
「あらゆること（omnibus）について（dē）疑うべきである（dubitandum）」と訳せます。